Bez použití hlavního hesla nejsou uložená hesla bezpečně šifrována a přístup k nim může získat kdokoliv, kdo má přístup k vašemu počítači. Pro zabezpečení uložených hesel před neoprávněným přístupem lze nastavit hlavní heslo, jímž budou v registrech Windows uložená hesla šifrována. Po nastavení hlavního hesla je přístup k uloženým heslům možný jen po jeho opětovném vložení.
Jako hlavní heslo můžete použít stejné heslo jako ve Správci hesel, nebo libovolné jiné heslo. V případě potřeby lze použít i různá hesla v různých kompresních profilech, i když to může být nepohodlné a náchylné k chybám.
Po vložení hlavního hesla je toto heslo platné pro všechny přístupy k heslu z profilu až do opětovného ukončení WinRARu nebo dokud nebude zvolen kompresní profil s jiným hlavním heslem. Chcete-li si ověřit, jak tato ochrana pracuje, nastavte hlavní heslo, zavřete a opět spusťte WinRAR.